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단백질-약물 결합을 분석할 때 중요한 요소

CADD 하는 사람들이 의약화학자에게 도킹 구조를 보여주면서, "이게 약이 될 것 같아요?" 라고 묻는 것은 아마 다들 경험해본적이 있을 것입니다. 의약화학자들이 어떠한 관점에서 이 문제에 대하여 답을 하는지 이해한다면, 좋은 CADD 툴을 만들 수 있을 것입니다. 많은 경우 생물학의 문제들에 대한 적절한 답은, "그때그때 달라요."입니다. 단백질-약물 결합에서도 마찬가지입니다. 주어진 타깃에 대해서 다를 것입니다. 그래도 제가 경험적으로, 그리고 많은 데이터로부터 알게 된 것에 대해 이야기하겠습니다. 저는 단백질-약물 결합에 어떠한 원리가 있는지 의문을 가지고 있습니다. 생물학에서 원리라는 것은 경험적이고, 물리학에서의 원리에 비하면 약한 것이겠지만, 그래도 좀 더 보편적으로 이해할 수 있는 무언가가 ..

하스스톤

하스스톤 처음 나왔을 때는 많이 했는데... 이제는 도저히 못따라가겠네요. 당시엔 유희왕이 생각나서 좀 특이하게 플레이해봐야겠다 싶어서, 코스트 낮은 카드나, 공격력이 낮은 카드만 덱에 넣어보기도 했습니다. 주로 사제로 플레이하면서 상대를 고쳐주면서 어그로를 끌기도 하고... 회복시 카드를 뽑을 수 있게 해주는 카드가 있기도 해서 손에 쥔 카드는 언제나 넉넉했습니다. 한번은 사제대 사제로 붙었는데, 상대의 캐릭터 빼앗는 스킬 써서 회복 사용시 카드 뽑기를 해주는 놈을 3마리 뽑아놨더니, 카드가 너무 심하게 많이 뽑혀서 더이상 뽑을 카드가 없어서 패배했던 적도 있습니다. 이것이 유희왕에서 본 덱 파괴 전술 인가... 이게 아닌데... 이게 아닌데... 이게 아닌데... 애용하는 카드는 퀘스트중인 모험가입니..

Game 2022.04.17

엉터리 수비드 (부채살)

수비드라는 개념도 생소하던 10년쯤 전에, 어떤 선배한테 들은 이야기대로 수비드를 만들어봤습니다. 통 부채살을 못 구해서 그냥 두껍게 썰어져 있는 것을 사서, 지퍼락에 넣고 냄비에 물 적당히 끓이고 손으로 만져가면서 느낌상 60도 정도 되도록 조절해서 했습니다. (집에 온도계도 없었습니다.) 그때는 아마 4시간 정도 했던 것 같네요. 이게 아마 수비드 첫 시도였던 것 같습니다. 뭐 지금은 오븐이 있어서 수비드 대신 그냥 오븐 이용해서 요리합니다. 뭐 엉터리로 한거지만, 그래도 잘 되었습니다. 촉촉하면서도 부드러웠던 것 같고...

Food 2022.04.17

양고기 오븐 구이

양고기는 제가 회사에 가끔 가져가는 요리 중 하나입니다. 양고기는 소나 돼지에 비해 부드럽습니다. 블로그 개설 후에 양고기 구이를 올린적이 없는 것 같아서 이번에 올리려고 만들었습니다. 고기는 1kg에 15000원 (배송비 별도) 정도 하는 어깨살입니다. 기름이 많고, 꼬치나 구이 만들기 좋은 부위입니다. 다음번에는 통구이도 해봐야겠습니다. 양고기를 칼로 적당히 잘라줍니다. 비닐봉지에 담습니다. 향신료를 준비합니다. 저는 양꼬치양념에다가, 카레가루 약간 (전분 들어있는거 말고, 향신료만 배합한 것), 브리스킷시즈닝, 케이쥰 시즈닝, 후추, 파프리카 가루, 바질, 생강가루, 다진마늘, 즈란(큐민) 등을 더 넣어주었습니다. 향신료를 봉지에 넣고 섞어줍니다. 잘 섞이면 2시간정도 냉장고에서 숙성합니다. 전에는..

Food 2022.04.16

다시마 숙성 연어 건조 , 오크라, 검보

요즘 러시아-우크라이나 전쟁 때문에 연어 값이 많이 올랐습니다. 마트 갔더니 잘 안 팔려서 그런지 할인을 하길래 충동적으로 구매해버렸습니다. 650g짜리입니다. 사실 저는 연어회가 느끼해서 잘 못 먹습니다. 그래서 조금 가공을 했습니다. 먼저 연어를 물로 깨끗히 씻은 후, 해동지로 물기를 닦아줍니다. 그다음 소금을 살짝 뿌려줍니다. (그냥 소금탄 술에 담궈버려도 되었을 것 같다는 생각이 듭니다. 그다음 마른 다시마를 위아래로 붙여줍니다. 그다음 종이로 감싼 후에, 냉장고에서 12시간 정도 숙성을 합니다. 보통은 여기서 끝내는데, 여기서 건조과정을 거치면 연어가 꾸덕해지면서 장기 보관이 가능해집니다. 훈제연어 만드는 것과 비슷하지만, 집에서 훈제를 하고 싶진 않아서 연기는 사용하지 않았습니다. 제가 사용하..

Food 2022.04.11

과학 연구에서 중요한것

흔히들 과학 연구에서 넘치는 창의력과 틀에 매이지 않는 아이디어가 중요하다고 생각합니다. 하지만, 새로운 가설을 제시하는 것보다는, 가설을 어떻게 검증할 것인가가 과학의 본질이라고 볼 수 있습니다. 과학은 크게 실험/경험/측정과 이론으로 나뉩니다. 우리가 측정을 통해서 알 수 있는 사실들이 있습니다. 측정에 오류가 있지 않았다면, 그것이 사실입니다. 이론은 그 측정 결과의 원인이나, 측정 결과들 사이의 관계를 설명하는 것입니다. 아마도 창의력을 이야기하는 것은 실험보다는 이론의 영역에 대한 것 같습니다. 유명한 과학자들은 보통 실험보다는 이론분야의 종사자들이 많기 때문입니다. 실험은 보통 절차와 방법론이 정해져 있습니다. 예를 들면 특정 신물질을 만들었다면, 기존 물질에서 측정하던 물성들을 그 물질에 대..