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집에 벌이 들어왔습니다. 항상 방충망을 닫아두는데 대체 어디로 어떻게 들어온 것인가요? (하루에 10마리씩 보이는 모기는 대체 어디로 들어오는 것인가요?) 그보다 이 벌 뭔가 무섭습니다. 말벌 같아보이는데... 크기는 한 2cm? 파리채로 밀면 파리채 위에 올라가는데, 파리채를 들고 창밖까지 데려가려 하면 계속 날아서 도망갑니다. 파리채로 쳐서 죽일 수 있지만 뭔가 귀여워보여서 안죽였습니다. 말 안듣는 놈이 귀여운 것이죠. 한 20번쯤 시도해서 겨우 내보냈습니다. 다신 오지마라! 올거면 집세를 대신 내주던가...

이야기 2021.10.12

음악을 좋아하게된 이야기

이야... 제가 가장 좋아하는 가수 정여진 님이 작년부터 유튜브 영상을 올리고 계셨네요. (95) 노래하는 정여진TV - YouTube 노래하는 정여진TV 요술공주 밍키, 빨강머리 앤, 슈퍼갤즈, 미소의 세상, 카드캡터 체리, 파워 디지몬, 아빠의 말씀, 포카리스웨트, Too Far Away 등등 3000여 편의 광고음악과 300여 곡의 애니송을 노래한 가수 정여진의 www.youtube.com 그걸 오늘에야 알게되다니... 흑흑흑... 별로 공연 활동 안 하셔서 유튜브 하실 거라고는 상상도 못 했습니다. 며칠 전 TJ 노래방에 트윈스피카 오프닝곡 약속의 별이 추가된 것을 알게 되어서 우연히 찾다가 알게 되었습니다. 10년도 전에 TJ 곡 신청 페이지에서 열심히 약속의 별 추가해달라고 했었는데... (투..

음악 2021.10.12

rdock: protein ligand docking 프로그램

AutoDock Vina 변종 위주로 사용하다가 기능적으로 만족스럽지 않은 부분이 있어서 다른 도킹 프로그램을 찾아봤는데, 그중 무료로 사용할 수 있는 성능이 좋아 보이는 프로그램으로 rdock이 있습니다. rdock의 차별점이라 할만한 주요 기능은 tether docking, pharmacophore docking입니다. 논문은 다음 주소에 있습니다. https://journals.plos.org/ploscompbiol/article?id=10.1371/journal.pcbi.1003571 docking을 하다 보면 대충 분자가 단백질에 어떤 포즈로 들어와야 하는지 보이는 경우가 있습니다. kinase protein의 hinge 영역처럼 특정 영역에 결합하는 분자에 몇 가지 패턴이 정해져 있는 경우도 ..

검보 만드는 방법

얼마 전 마트에 갔다가 생 오크라를 발견해서 사 왔습니다. 요즘 냉동 오크라는 구하기 쉬운데, 생 오크라는 특정 시기밖에 안 나오니까 발견하면 안 살 수가 없네요. 사놓고 며칠 방치하다가 오늘에야 검보를 만들었습니다. 이번에는 검보 믹스를 사용하지 않고 검보를 만들었습니다. 그래도 케이준 시즈닝 정도는 사용했습니다. 이전에 검보 만들었던 글, 이때는 베이스를 사용했습니다. 검보 재료: 새우 많이 (예전엔 큰 사이즈를 썼는데 이번엔 작은 사이즈를 많이 넣는 쪽으로 해봤습니다.) 양파 1개 반, 양배추 잎 4 장, 생마늘 약간, 당근 약간, 표고버섯 2개, 애호박 약간, 무 약간, 소시지 2개 홍합육수 (고기 육수나 그냥 물 넣어도 됩니다. 그래도 멸치육수는 좀 아닐 듯... 원래는 닭 육수가 어울릴 겁니다..

Food 2021.09.26

의약화학: ACE 억제제 (고혈압 치료제)

ACE 억제제는 고혈압 치료제 중 하나입니다. 제가 먹고 있는 약 중 하나이고, 자신이 먹는 약에 대해서 공부하는 게 좋다고 생각해서 공부 중입니다. 그리고 제가 보고 있는 의약화학책에도 ACE 억제제 설계에 대한 이야기가 소개되어 있습니다. (사실 책에 소개된 약물과 제가 먹는 약물의 구조가 좀 다릅니다.) ACE는 안지오텐신 전환효소 (Angiotensin-converting enzyme)입니다. 안지오텐신 II (Angiotensin II)는 강력한 혈관 수축 호르몬인데, 혈관이 수축되면 혈압이 상승하고, 혈관이 이완되면 혈압이 하강하므로, 안지오텐신 II의 형성을 억제한다면 혈압을 낮출 수 있습니다. ACE는 안지오텐신 I (Angiotensin I)을 안지오텐신 II로 변환합니다. Angiote..

Drug 2021.09.24

분자 SMARTS 문법 및 rdkit에서 SMARTS 탐색

SMILES에 대한 설명은 이쪽에서 확인하실 수 있습니다. https://novelism.tistory.com/106 SMARTS의 문법은 복잡해서 하나하나 자세히 설명하긴 어렵고 자주 쓰는 것 몇 개만 이야기하겠습니다., rdkit에서 SMARTS로 분자 탐색을 하는 사용법 위주로 설명하겠습니다. SMARTS 규칙은 https://www.daylight.com/dayhtml/doc/theory/theory.smarts.html 에서 볼 수 있습니다. Daylight Theory: SMARTS - A Language for Describing Molecular Patterns 4. SMARTS - A Language for Describing Molecular Patterns Substructure se..

분자 SMILES 문법 및 변환

관련글: https://novelism.tistory.com/241 Marvin JS demo를 사용해서 분자 SMILES, SMARTS 얻기 이전에 SMILES와 SMARTS에 대해 포스팅을 했습니다. 직접 SMILES과 SMARTS를 만드는 건 좀 번거롭고 어렵기에 보통은 분자 그림을 변환 툴을 사용합니다. chemaxon의 marvin을 이용해서 SMILES와 SMARTS를 얻을 novelism.co.kr SMILES (Simplified molecular-input line-entry system) 은 분자를 문자열로 표기하는 방법 중 하나입니다. 기초적인 문법은 위키피디아에 잘 설명되어있습니다. https://en.wikipedia.org/wiki/Simplified_molecular-input..

I just called to say I love you -Stevie Wonder

(64) Stevie Wonder - I Just Called To Say I Love You 1984 (High Quality) - YouTube I just called to say I love you는 Stevie Wonder의 곡으로 가사가 무척 아름답습니다. 1년 12달의 대표적 절기들을 나열하는데 상당히 센스가 있습니다. 딱히 절기를 나열하려고 하는 곡은 아닙니다. 곡 내용은 그냥 전화를 했다는 이야기인데, 명절에 형식적으로 문안 인사차 전화한 건 아니고, 명절도 아닌데, 그냥 평범한 날인데, 단지 사랑한다는 말을 하려고 전화했다는 내용입니다. Isn't she lovely와 더불어 순수한 사랑이 느껴지는 곡입니다. 명절을 약간 돌려서 그날 하는 일로 표현하는 것이 재미있습니다. 뭐 한국 명절..

음악 2021.09.21

튀김

추석하고 별 관련 없지만 튀김을 만들었습니다. 새우튀김, 베이비 크랩 튀김, 무 튀김, 생선가스(대구), 오징어, 낙지 등등... 재료들을 잘 씻고 세척합니다. 새우는 내장을 빼고, 꼬리의 물주머니를 잘라줍니다. 일부 재료는 싱거워서 소금 간을 해줘야 합니다. 튀김가루를 비닐봉지에 넣고 베이비 크랩을 넣고 흔들어줍니다. 그러면 잘 가루가 잘 묻습니다. 튀김가루를 물에 적당히 풀어주고, 베이비크랩에 반죽을 입혀줍니다. 끓는 기름에 투하... 열심히 투하... 많이 튀기다 보면 손에 기름이 튀어도 아프지 않습니다. 에어프라이어에 돌릴거라서 좀 덜 익어도 상관없습니다. 에어프라이어에 한번 돌려서 기름기를 빼줍니다. 더 바삭하게 만들고 싶으면 온도를 180도 정도로 높게 잡습니다. 대구는 전감인데, 뼈를 잘 제..

Food 2021.09.20