Novelism

판체타 만들기 실패

콴찰레나 판체타로 파스타를 만들면 맛있습니다. 그런데 둘 다 엄청 비쌉니다. 그럼 직접 만들면 어떨까 해서 몇 년 전부터 시도했습니다.대부분 실패했습니다만... 이건 2024년 1월쯤 했던 거 같네요. 밖에서 건조해야 하다 보니 추운 계절에 했습니다. 삼겹살 끝에 붙어있는 미추리로 만들었습니다.마트에서 삼겹살 주문했더니 미추리를 보내줘서요. 오도독뼈가 없는 건 좋은데, 미추리는 지방이 적은 게 흠이네요. 향신료 이것저것에 소금 넣고 냉장고에서 1주일 정도 염지를 했습니다. 소금은 1~2% 사이로.. 1주일 후 향신료를 털어내고 물로 씻은 후 건조기에서 먼저 건조시켰습니다. 베란다에서 건조시키긴 했는데.. 중간에 곰팡이가 생겨버렸네요. ㅠㅠ 폐기... ㅠㅠㅠ 다시 했습니다.이번엔 2025년 1월입..

신소재 개발 일을 시작하면서 갑자기 욕구가 하나 생겼습니다. 뭔가 소재로 사용하는 금속들 1kg씩 사다가 집에 쟁여두고 싶어 졌습니다. 저는 물질을 사랑합니다. 물질주의자입니다. 그래도 돈이 없으니까 귀금속은 어렵고... 일단 텅스텐이나 티타늄 같은 거 1kg씩 사야겠네요. 근데 은으로 컴퓨터 쿨러 방열판 만들면 어떨까 하는 생각이 듭니다. 은은 그렇게까지 비싸지 않으니까 한 100g 정도 써서 만들면 나쁘지 않을지도? 재활용도 할 수 있고...

2024년 8월 26일에 사업자 등록을 했으니 오늘로 시작한 지 1년이 됩니다. 뭐 딱히 기념할만한 것도 아닙니다만... 회사에서 일하던 시절과 비교하면, 소득은 반으로 줄었고 그때보다 훨씬 바쁘게 일하고 있습니다. 사업 적으로라면 뭐 아주 잘못된 일이라고 할 수 있겠네요. 그래도 직장 다니던 시절과 비교하면 지금이 더 만족스럽습니다. 저는 제가 하고 싶은 연구를 합니다. 열심히 일하고 금융 투자해서 돈을 벌고 그 돈을 가지고 개인 연구에 씁니다. 돈 버는 일을 더 늘리면 개인 연구할 시간이 부족해지네요. 제 돈을 주고 제 인생을 사겠습니다. 아마도 그냥 내가 하고 싶은 대로 연구를 하는 것이 제가 창업한 진짜 이유였던 것 같습니다. 1인 연구자이다 보니 큰 연구는 할 수 없습니다. 그..

저는 관심 분야가 좀 넓은 편입니다. 그만큼 깊이와 지식, 해당 분야에 대한 상식이 부족합니다. 몇 년 전부터 그냥 흥미가 있어서 혹은 자신에게 필요해서 한 연구들이 있습니다. 이걸로 논문을 어떻게 써야 하나 영 모르겠습니다. 유사한 연구가 있는지 잘 모르겠고.. 검색해 봐도 뭔가 비슷은 하지만 취지는 많이 다른 것 같고... 전공 분야가 아니다 보니 딱히 제가 아는 사람 중 그 분야에 대해 잘 알고 도와줄 사람도 없습니다. 제가 생각하는 취지가 잘 전달될지 모르겠습니다. 그래도 ChatGPT는 잘 이해하더군요. 그다음에 유사한 연구 찾으라니까 찾아오는 게 다 좀 다른 거 같아서 문제이지... 연구에 대해 자세한 이야기를 하고 싶지만, 아직 공개하기는 어렵네요. 그중 하나는 전사체 발..

저는 자신이 재수가 없다고 생각합니다. 그런 소리 많이 들은 것 같습니다. 대체로 잘 되는 일은 얼마 없었네요. 운에 기대서 성공한 일도 없고요. 운과 실력은 뭐가 다른것일까요? 어떤 사람은 운도 실력이다.라고 말을 합니다만... 그렇게 생각해도 되는 것일까요? 아마도 통념적으로 꾸준히 작용할 수 있는 것이 실력일 것입니다. 꾸준히 운이 좋다면 그것도 실력이라고 인정하겠지만, 우연히 요행이 일어난 일이 지속되지 않는다면 그저 운 이겠죠. 좋은 운은 오래 지속되지 않는다.라는 가정에서의 이야기입니다만... 반대로 나쁜 운도 오래 지속된다면 그것은 실력이 나쁘다.라고 해석할 수 있는 걸까요? 그렇게 보면 저는 실력이 없는 것이 맞습니다. 그런데 올해 상반기에 운이 좀 좋았습니다. 그래서 저는 궁금..

오랜만에 논문을 썼습니다.마지막 논문이 2019년도였으니 한참 전이네요. 그동안 회사 다니면서 딱히 논문을 써야 할 필요가 없어서 잘 쓰지 않고 있었습니다.뭐 정부 과제 실적을 위해서 쓰라고 강요하는 사람들이 있긴 했지만, 제가 납득할만한 논문이 될만한 연구는 아니었습니다. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.08.12.670002v1 https://github.com/novelism/FragDockRL GitHub - novelism/FragDockRL: Licensed under a Custom Non-Commercial License. Commercial use requires permission.Licensed under a Custom Non-C..

vina 계열 도킹 프로그램은 여러 가지가 있습니다. 순정 AutoDockVina 도 있지만, 가장 빠른 qvina 라든가, 사용성이 개선된 smina도 많이 사용됩니다. 이들은 분자의 rotatable bond와 그렇지 않은 본드들을 통해서, 회전할 수 있는 영역과, 한 평면에 위치하는 영역을 구분합니다. 그리고 한 평면에 위치하는 것들은 강체 조각처럼 취급하고 (bond, angle 변화 없는) 회전가능한 영역들에 대해서 torsion 탐색을 합니다. smina 는 flexible side chains docking을 지원합니다. 물론 vina 도 지원합니다. 이것은 flex 옵션으로 들어간 pdbqt에 대해, root로 지정된 조각을 고정시키고 나머지들을 회전시키는 방식으로 구현됩니다. 원래는 여..

신약개발 책에서 감명 깊게 읽은 문장이 있습니다.링컨의 명언이었는데, 나무를 베는데 8시간이 주어진다면 그중 6시간은 도끼를 가는데 쓸 것이다. 라는 말이었습니다. 인터넷 찾아보니 6시간-4시간, 1시간-45분 등으로 다양하네요... 원문이 몇시간인지 모르겠습니다. 네. 현실적이고 훌륭한 말입니다. 근데 말입니다. 일단 저에게 골치아픈 일을 하라고 8시간이 주어진다면 그중 6시간은 맨탈이 나가서 방황하다가 결국 2시간동안 일할 것입니다. 지금이 바로 그렇습니다. 그래서 바쁜데 이런 글을 쓰고 있는 것입니다. 과도한 부담이 주어지면 일이 손에 잡히지 않네요. ㅠㅠ