Novelism

저는 대학, 대학원에서 물리학을 전공하였습니다. 그것도 기초과학 분야이고, 이론적이고 원리를 밝혀내는 부류의 소위 돈 안되는 연구에 가까웠습니다. 지금은 물리학과는 좀 다른 분야, 그것도 회사에서 일하고 있습니다. 어찌보면 지금 하는일과 전공이 무슨 상관이 있냐?... 박사 뭐하려고 했냐? 의미 없는 시간 아니었냐 라고 할 수도 있지만, 오늘의 자신이 있는 것은 과거의 자신이 있었기 때문이라고 생각합니다. 오늘은 그냥 제가 살아오면서 느껴온 이야기들을 좀 적어보고 싶습니다. 제가 물리학에 매료된 것은 상대성 이론과 양자역학이 나온 시대를 동경하고 그리고 그 시대를 살아가던 훌륭한 선배님들을 동경했기 때문이었습니다. 그 중에는 워낙 대중적으로도 유명해서 모르는 사람이 없을만한 분들도 계십니다. 아인슈타인,..

저는 세기말의 초딩(패왕?)이었습니다. 초딩은 원래 패기가 넘치는 것입니다. 제가 초딩 때는 미래에 세상이 혼란에 빠질 것이라 느끼고 그 세상을 안정시키기 위한 철학을 만드는게 꿈이었는데... 아무튼 그때는 20세기 말이었고, 21세기는 뭔가 미래라고 생각되던 시기였습니다. 시간적으로는 그미래가 오늘이 되었지만 과거에 상상하던 미래의 모습중 정말로 현실이 된것은 별로 없는 것 같습니다. 그 현실중 하나는 미래의 휴대가 가능한 컴퓨터... 스마트폰 입니다. 대부분 사람들이 스마트폰을 가지고 다니지만, 지금도 컴퓨터가 있죠. 많은 기능은 스마트폰으로 가능하지만, 굳이 대체 했다기보다는 용도가 다르다 라는 느낌이 듭니다. 스마트폰은 작은 컴퓨터가 아닙니다. 컴퓨터를 소형화하고 운반 가능하게 하려는 관점에서 나..

아마도 저 이전 세대들... IMF 이전에 초중고를 다니던 세대는 아시겠지만... 김밥은 귀한 음식이었습니다. 소풍 때나, 운동회날 전날에 재료를 준비하고 새벽부터 일어나서 싸야하는 힘든 요리였습니다. 그리고 IMF가 터지고 김밥천국이 생기고 1000원짜리 김밥이 등장하면서 그냥 아무때나 먹을 수 있는 음식이 되었습니다. 저도 참 좋아하는데... 하지만 요즘엔 죄다 가격이 올라서 기본 2천원이 된거 같네요. 이동네는 김밥 한줄이 3~4천원이라서 저는 그냥 제가 싸먹습니다. 김밥 맛있는 곳도 안보이고... 재료를 많이 넣을 경우, 김밥의 밥알은 1층~2층 정도가 적당하다고 생각합니다. 그 이상 밥을 넣으면 너무 커서 안말립니다. 처음 할 때는 엄청 실패했지만, 뭐든 하다보면 처음보단 나아질 것입니다. 일단..

주의: 이 결과물이 술이 될 수도 있으니 미성년자는 따라하지 말아주시기 바랍니다. 지금까지 이런 음료는 없었다. 이것은 포도주인가 포도주스인가...? 작년 가을부터 여러번 만들어먹었는데 맛있었습니다. 먹어본 사람들도 맛있었다고 했던 것 같습니다. 일단 포도를 삽니다. 저는 돈이라면 벌벌 떠는 사람이라 그냥 싼거 샀습니다. 캠벨이나 머루포도 같은거 할인하는거 잘 찾아보세요. 한 박스 3kg 정도 짜리입니다. 상태가 별로 좋지 않아보이지만 뭐 어짜피 주스인데... 잘 씻어줍니다. 농약이나 먼지 오염이 걱정되면 열심히 씻어줍니다. 그리고 물을 빼줍니다. 집에서 놀고있는 술통에 담아줍니다. 가능한 술통도 깨끗이 씻어서 잘 말려줍니다. 알코올로 소독해도 좋습니다. 장갑을 끼고 포도를 으깨줍니다. 주먹으로 누르고 ..

중국식 맛탕 바쓰 만드는 방법입니다. ko.wikipedia.org/wiki/%EB%B0%94%EC%93%B0 바쓰 - 위키백과, 우리 모두의 백과사전 위키백과, 우리 모두의 백과사전. ko.wikipedia.org 그냥 편이상 맛탕이라 적었지만, 양념 치킨과 닭강정만큼이나 다른 요리입니다. 저는 요리를 감으로 합니다. 저울? 없습니다. 온도계? 없습니다. 시간? 제 마음속의 비트뿐 저는 과학자이긴 한데... 과학자에게 너무 많은것을 기대하면 안됩니다. 우선 고구마를 자르고 튀깁니다. 적당히... 적당히라고 하면 다 적당히 하면 됩니다. 요리를 처음부터 성공할 생각 하지 마세요. 뭐든 실패하고 시행착오로부터 배우는 것입니다. 실패로부터 배우는 사람은 어리석은자이지만 바보가 아닙니다. 다 튀겨지면 일단 접..

저도 머신러닝 기반 분자생성 논문을 썼지만, 머신러닝 기반 분자생성 방법들 중 쓸만한게 거의 없습니다. 논문 저자들 중 자신이 만든 메소드를 계속 쓰는 사람이 있는지 궁금할 정도입니다. 여러가지 문제가 있지만, 일단 데이터를 통한 학습이라는 것이 데이터로부터 자유롭지 못하다는 것과, 합성가능성을 고려하기 어렵다는 점이 문제입니다. 학습한 데이터와 다른것이 생성되었다면, 그것이 머신의 창의력의 결과이기보다는 학습이 잘못되어서 나왔을 가능성이 높습니다. 그리고 사이드 체인에 뭔가 많이 붙었지만, 그게 정말 필요해서 붙었는지, 아니면 머신의 학습 오류인지 판단하기도 어렵습니다. AE 기반 분자 생성 모델에서 AE의 reconstruction조차 100%가 안되는데... 생성할 때 붙는 무언가도 노이즈에 의한 ..

말하지 않아도 알아요. 그낭 바라보면... 이라는 광고가 있었습니다. 초코파이 情 (아홉) 제 지도교수님이 어느날 저에게 "니가 무슨 생각하는지 아무도 모르고 관심도 없다." 라고 말씀하셨습니다. 제가 너무 답답해서 하신 말씀 같은데, 저는 이 말을 제일 감사하게 생각합니다. 왜냐하면 저는 그 사실을 정말로 모르고 있었으니까요. 저는 사람들이 모든것을 안다고 (혹은 내 머리속을 안다고) 착각하고 있었습니다. 제가 약간 머리속을 들키는 것을 싫어하는 성향도 있었고요. (지금은 반대로 제가 생각하는 것을 다른 사람에게 이해시키는게 너무 어려워서 어떻게든 이해할 수 있는 사람을 찾고 싶을 정도인데... ) 그러니까 그 전까지 저는 사람들과 대화를 제대로 하지 못했습니다. 누가 무엇을 아는지 모르는지, 무엇에 ..

민주국가에 살고 있지만, 애석하게도 우리가 한 선택이 최선이었는지 항상 의문이 듭니다. 그래도 저는 민주주의를 좋아합니다. 민주주의는 핵심은 자신들의 문제를 자신들이 고민하고 자신들이 선택하고 그 결과를 자신들이 책임지는 것이라 생각합니다. 민주주의는 고민하고 대화하고 토론하는 과정으로 이루어지고, 구성원에 대한 상호 존중이 필요합니다. 대화와 토론에서 결론이 내려지면 좋은 일입니다만, 그렇지 않을 경우 (혹은 단순히 수렴을 위해서) 투표로 이어집니다. 고민과 대화 없는 투표는 의미가 없다고 생각합니다. 이런 결정과정이 결코 최선의 결과를, 혹은 최악의 결과를 피하는 것을 보장하지 않습니다. 사람은 실패를 경험하기 마련이며, 인간 사회 또한 마찬가지입니다. 중요한 것은 실패를 받아드리고 책임지고 더 나은..

제가 단백질 구조 예측 분야를 연구하던 시절엔 구조 예측에 만에 집중했고, 단백질 하나 하나에 대한 연구를 별로 하지 않았습니다. 그러다보니 단백질 구조 예측을 해도 그것을 어디에 어떻게 사용할지에 대해서 깊히 생각해보지 않았습니다. 신약개발 분야로 넘어오면서 여러 단백질에 대해서 구조를 분석하다보니 여러 재미있는 점들을 알 수 있었습니다. 인간 단백질들 중에서 패밀리 단백질끼리는 서열이 매우 (50% 이상?) 유사합니다. 구조 또한 거의 유사합니다. 약물의 단백질에 대한 결합 여부를 실험해보면 패밀리에 속한 단백질 끼리는 상관성이 매우 높게 나올 것입니다. 슈퍼 패밀리라 할 수 있는 단백질들은 서열 유사성이 20% 정도로 떨어지지만, 전체적인 구조는 유사합니다. 그런데, 슈퍼 패밀리에 속하는 포켓 구조..

여러 연구실에서 주기적으로 그룹미팅을 합니다. 그런데, 어떤 분들은 그 자리를 자신이 업무 보고 받는 자리라고 생각하는 것 같습니다. 전 구성원이 참여했는데, 본인이 듣고 싶은것만 들으려 하고, 질문은 본인만 하고, 본인이 마음에 들지 않으면 발표를 진행하지 못하게 합니다. 솔직히 저는 참여해도 제 일이 아닌거 듣는것도 별로 흥미가 안생기고... 업무 보고를 원한다면 그냥 둘이 만나서 하는게 나은게 아닌가 같은 생각이 듭니다. 업무 보고가 아니라면 좀 더 구성원들이 자유롭게 의견을 교환할 수 있게 운영해야 합니다. 솔직히 그룹미팅 자리에서 듣고 질문하는 것보다는 궁금하면 나중에 직접 만나서 이야기하는게 더 편했습니다. 그리고 그 자리에서 도움을 요구하는 사람도 별로 없고요. 그냥 도움이 필요하면 개인적으..