2021/07 22

AlphaFold CASP14 논문이 나왔네요.

https://www.nature.com/articles/s41586-021-03819-2?fbclid=IwAR2-w88mv6s0fUQzsBWQ3JIF2L2ztOElJj8n64bbhpZ4oxoozdXpNeHd_9I 제목 참 심플하네요. Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold 하는 김에 깃허브 공개까지 되었습니다. https://github.com/deepmind/alphafold?fbclid=IwAR2gEAd6akjuDwiVUlMsQ8ORSpiw43SchfQ4ztjqk7MHnNNUdn46RmVliu0 나오는 김에 David Baker 그룹 논문도 나왔네요. https://science.sciencemag.org/content/early/..

부채살 스테이크, 로스트비프, 근막 구이

오랜만에 부챗살을 샀습니다. 미국산, 냉장 숙성이고 2.5kg입니다. 기름과 근막을 제거해줍니다. 손질 실력이 안좋아서 살코기가 근막에 많이 붙었습니다. 저는 근막을 버리지 않고 구워 먹습니다. 이걸 먹는 사람은 매우 드물것 같네요. 잘 구우면 맛있습니다. 기름진 고소한 껌 같은 느낌입니다. 질긴 고기는 근막도 질기고 딱딱합니다. 이 고기는 부드럽고 맛있었습니다. 생선회 뜰때 사용하는 해동지로 고기를 잘 닦아줍니다. 해동지는 흡수능력이 매우 뛰어난 종이입니다. 회뿐만 아니라 튀김 같은 물기를 제거해야 하는 다른 요리에도 사용하기 좋습니다. 키친타월보다 흡수력 면에선 좋습니다. 건조기로 고기를 1시간 정도 건조시켜줬습니다. 대충 사진 보시면 살짝 마른 것이 보일 것입니다. 두께는 2cm입니다. 고기를 건조..

Food 2021.07.15

스텐팬 계란후라이, 볶음밥

180도 정도로 예열하고, 카놀라유 발라줬습니다. 계란 프라이 달라붙지 않습니다. 전날 미리 만들어두고 냉장고에 식혀둔 현미 100% 로 만든 볶음밥입니다. 볶음밥도 달라붙지 않습니다. 볶음밥에 굴소스 넣어도 달라붙지 않습니다. 씹는 맛이 좋습니다. 냄비에 들어있는 것은 파 육개장을 만들려다 뭔가 이상해진 양파 육개장 들깨가루를 넣어서 색이 연합니다. 재료: 소고기 부챗살, 무, 파, 양파, 마늘, 다시마, 간장, 표고버섯, 양송이버섯, 고춧가루, 들깻가루, 후추, 생강청

Food 2021.07.15

포도주스 - 이니아 블랙포도

포도주스 맛있습니다. 이번에는 이지아 블랙 포도를 구입했습니다. 칠레산이고, 당도는 20~22 브릭스라고 하네요. 상당히 달고, 신맛은 적은 편입니다. 씨 없고 과육과 껍질은 부드러워서 껍질채 먹을 수 있습니다. 겉으로 보기엔 캠벨과 비슷해보이지만, 캠벨의 과육은 질긴데 반해 이지아의 과육은 질기지 않습니다. 약간 블루베리나 꽃과 비슷한 향이 있습니다. 인터넷에서 1kg에 6천원이라는 가격에 팔더군요. 6kg 주문했습니다. 1kg (3송이)씩 3봉지에 담겨있습니다., 1박스에 3kg입니다. 2박스가 배송되었습니다. 너무 많아서 주스는 5kg만 만들었습니다. 일단 한번 세척해주고, 포도 알갱이를 따서 다시 세척한 후 물을 빼줍니다. 그리고 통에 담고 믹서로 갈아줍니다. 과육이 부드러워서 손으로 으깰 수도 ..

Food 2021.07.13

청주 만들기

예전에 옆집 사람과 함께 자주 술을 빚었는데... 술빚은 거 힘듭니다. 그 사람이 이사 가버리고 혼자서 힘들어서 못하겠네요. 일단 찹쌀을 물에 불린 후 1시간 동안 찜통에 쪄서 고두밥을 만듭니다. (맛있다고 옆집 사람이 주워 먹습니다.) 그리고 식혀줍니다. 항아리에 밥을 담고, 누룩을 섞어줍니다. 밀누룩을 사용했습니다. 물을 부어줍니다. 옆집 사람이 제주도 사람이라 삼다수를 사용했습니다. 효모 좀 넣어줍니다. 누룩은 쌀의 녹말을 단맛이 나는 단당류, 이당류로 가수분해하고, 효모는 그 분해된 당을 먹고 알코올 발효를 일으킵니다. 누룩에 효모가 섞여 있을 수도 있지만 추가로 더 넣어줬습니다. 여기까지가 밑술이고, 이대로 3~5일 정도 발효시켜 줍니다. 그리고 새로 고두밥을 만들고 물과 함께 밑술에 더 넣어줍..

Food 2021.07.12

돈냉면

돈까스 + 냉면 놀라운 조합입니다. 이게 왜 놀랍냐면, 돈까스가 바삭합니다. 물에 빠졌는데 바삭합니다. 신기합니다. 냉면은 주로 갈비와 함께 먹거나, 회무침과 함께 먹었지만, 돈까스와도 잘어울립니다. 아마 작년에 찍은 사진 같은데, 율전동 떠난지도 오래되서 가게들 잘 모르겠네요. 가게 이름이 여러번 바뀐 것 같은데, 예전에 알던 가게가 이름 바꾼 것인지 새로 생긴것인지 모르겠네요. 현재 이름은 매콤돈가스&칡불냉면 인것 같습니다. http://kko.to/2guRjbT4M 포크포크매콤돈가스&칡불냉면 경기 수원시 장안구 서부로2106번길 14 map.kakao.com

Food 2021.07.12

복날: dog days (개드립)

무더운 여름날입니다. 자세한 설명은 위키피디아를 참고하시고... https://ko.wikipedia.org/wiki/%EB%B3%B5%EB%82%A0 복날 - 위키백과, 우리 모두의 백과사전 초복/중복/말복공식이름삼복장소대한민국, 중국, 일본날짜하지로부터 세 번째 및 네 번째, 입추로부터 첫 번째 경일(초복, 중복, 말복 순)2020년2021년2022년2023년7월 16일, 7월 26일, 8월 15일7월 11일, ko.wikipedia.org 2021년 복날 초복은 7월 11일, 중복은 7월 21일, 말복은 8월 10일 입니다. 복날 이야기를 꺼낸 것은 개드립을 치기 위해서입니다. 예전에 연구실에 외국인들이 여럿 있어서, 복날을 영어로 설명해야겠는데 잘 모르겠어서 도그데이라고 했던것 같습니다. 한자로 ..

Food 2021.07.12

역사를 배우는 이유

역사를 배우는 이유가 하나뿐일 수도 없고, 모든 사람에게 이유가 같을 수도 없으니 그냥 제 이야기를 하겠습니다. 사람은 무언가를 원하지만, 자신이 무엇을 원하는지, 왜 원하는지를 명확히 모를 때가 많습니다. 저는 역사를 배워야 한다고 생각하면서도, 그 이유를 몰랐습니다. 대학생 시절 교양 수업으로 역사 관련 과목들을 배우면서, 그 이유를 찾고싶어했습니다. 단순히 생각하면 역사는 어느정도 반복되는 것이고, 교훈이기 때문에, 배워두면 유용하다고 생각했습니다. 하지만 그것만으로는 납득이 안되고 만족할 수 없었습니다. 왜냐하면 저는 남의 역사보다, 우리의 역사를 배우는 것이 중요하고, 고대사보다는 현대사를 배우는 것이 더 중요하다고 생각했습니다. 단지 교훈을 얻기 위해서라면, 굳이 우리의 역사를 배울 필요 없이..

이야기 2021.07.10

bioinformatics 적인 관점에서 신약개발

인간의 특정 단백질에 결합하여 단백질의 기능을 활성화하거나, 저해하는 약물로 한정해보겠습니다. uniprot에 등록된 인간의 단백질은 2만여개정도입니다. 단백질들은 기능에 따라서, 진화적인 이유로 서로 유사한 구조를 가지고 있는 경우가 많습니다. 구조가 유사한 단백질들을 패밀리로 묶으면 1000~2000 종류가 있다고 합니다. 같은 패밀리에 속한 단백질은 포켓 구조까지 유사하고, 따라서 약물에 대한 결합력도 유사한 경우도 많습니다. 여기서 거꾸로 생각해보면, 내가 어떠한 타겟 단백질의 어떤 포켓에 결합하는 약물을 찾고 싶다면, 기존에 신약으로서 개발되던 (적어도 임상 1상 이상까지 진행된), 약물중의 누군가 중에서 타겟 단백질의 포켓에 결합할 수 있는 약물이 있을 가능성이 높다고 생각할 수 있습니다. 특..