PDB 파일 포맷은 단백질과 그 외 분자들의 실험 구조를 기록하기 위해 사용됩니다. (주로 x-ray 결정 구조) 다른 분자 파일 포맷과 비교하면, 단백질 구조를 기록하는 것에 최적화되어있습니다. 3D 구조에 대한 섹션은 "ATOM ", "HETATM", "CONECT" 이 셋입니다. 단백질의 구조를 기록하는데 최적화되어있다는 의미는, 분자를 아미노산 단위로 인식한다는 것입니다. 20가지의 기본 아미노산들에서, 각 원자들마다 고유의 이름이 붙습니다. (4칸) main chain에 " N ", " C ", " CA ", " O " 이 있고, side chain은 " CB ", " CG " 순으로 기록됩니다. 그리고 원자마다 속한 아미노산의 3 코드가 함께 기록됩니다. 이 두가지 정보만 가지고 원자들 사이의..