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2022/06/19 1

smina 용 금속 이온 도킹 옵션

Autodock Vina 변종중 하나인 smina에서 사용하려고 만든 금속이온에 대한 결합력 스코어입니다. smina --custom_scoring custom_scoring.txt 옵션을 추가해주면 됩니다. custom_scoring.txt 파일엔 다음 내용을 넣어줍니다. 일단 weight parameter는 -1.0으로 설정했지만, 도킹이 잘 안될경우 더 증가시키는 방향으로 조절할 수 있습니다. $ cat custom_scoring.txt -0.035579 gauss(o=0,_w=0.5,_c=8) -0.005156 gauss(o=3,_w=2,_c=8) 0.840245 repulsion(o=0,_c=8) -0.035069 hydrophobic(g=0.5,_b=1.5,_c=8) -0.587439 non_..

Drug/Computer-Aided Drug Discovery 2022.06.19
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검보 요리, 안전교육 만화, hot dog days, Enrichment Factor, 양다리, 뭉티기 양념장, AutoDock Vina, 뭉티기 양념장 만들기, 캐이준 요리, 인공지능 신약개발, 단백질 구조 예측, 기름 안튀게 고기 굽기, 핫도그 데이, /dev/nvidia0: no such file or directory, 볶음밥, 포도주스, 복날, 인공지능 신약개발 회사, 핫도그, Protein,

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