pybel: openbabel python interface, 수소 추가, protonation state
openbabel 은 콘솔에서 직접 명렁어로 실행할 수도 있지만 (obabel 등) python interface로 모듈을 불러올 수도 있습니다. rdkit과 비슷한 기능을 하긴 하는데, 사용법이 더 어렵고, 메뉴얼이 불편합니다. 그래도 나름 장점도 있어서 openbabel을 사용해야 하는 경우도 있습니다. openbabel 을 설치하기 위해선 일단 openbabel을 설치합니다. openbabel2와 openbabel3의 구조가 조금 다릅니다. 예를들면 pybel 모듈이나 openbabel module을 import하기 위해서 버전 3에선 다음과 같이 입력합니다. from openbabel import pybel from openbabel import openbabel 하지만 버전 2에선 import ..