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2022/12/12 1

아미노산 종류에 따른 residue-residue contact 비율

아래 그림은 2018년도에 모니터 화면을 찍은 것입니다. 생각해보면 좀 아쉬운데... 단백질 구조들을 모아서 아미노산 종류에 따른 contact 비율을 그려본 것입니다. (노말라이즈도 이미 했습니다.) x,y축은 각각 아미노산의 종류고 (20종) color는 contact 비율입니다. 아미노산마다 residue-residue contact 비율이 다름을 볼 수 있습니다. 당연히 그렇겠죠. 서로 같은 전하를 가진 아미노산이 접촉되기는 어렵고, 서로 다른 전하를 가진 아미노산들은 상대적으로 서로 접촉되기 쉬울 테니... 4번의 가장 밝은 노란색이 무슨 아미노산인지는 안봐도 추측할 수 있습니다. 시스테인입니다. 시스테인은 다른 시스테인과 disulfide 결합을 하는데, 다른 조합에 비해서 contact 비율..

Physics and Informatics 2022.12.12
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