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2021/09/23 2

분자 SMARTS 문법 및 rdkit에서 SMARTS 탐색

SMILES에 대한 설명은 이쪽에서 확인하실 수 있습니다. https://novelism.tistory.com/106 SMARTS의 문법은 복잡해서 하나하나 자세히 설명하긴 어렵고 자주 쓰는 것 몇 개만 이야기하겠습니다., rdkit에서 SMARTS로 분자 탐색을 하는 사용법 위주로 설명하겠습니다. SMARTS 규칙은 https://www.daylight.com/dayhtml/doc/theory/theory.smarts.html 에서 볼 수 있습니다. Daylight Theory: SMARTS - A Language for Describing Molecular Patterns 4. SMARTS - A Language for Describing Molecular Patterns Substructure se..

Drug/Computer-Aided Drug Discovery 2021.09.23

분자 SMILES 문법 및 변환

관련글: https://novelism.tistory.com/241 Marvin JS demo를 사용해서 분자 SMILES, SMARTS 얻기 이전에 SMILES와 SMARTS에 대해 포스팅을 했습니다. 직접 SMILES과 SMARTS를 만드는 건 좀 번거롭고 어렵기에 보통은 분자 그림을 변환 툴을 사용합니다. chemaxon의 marvin을 이용해서 SMILES와 SMARTS를 얻을 novelism.co.kr SMILES (Simplified molecular-input line-entry system) 은 분자를 문자열로 표기하는 방법 중 하나입니다. 기초적인 문법은 위키피디아에 잘 설명되어있습니다. https://en.wikipedia.org/wiki/Simplified_molecular-input..

Drug/Computer-Aided Drug Discovery 2021.09.23
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