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rdock: protein ligand docking 프로그램

AutoDock Vina 변종 위주로 사용하다가 기능적으로 만족스럽지 않은 부분이 있어서 다른 도킹 프로그램을 찾아봤는데, 그중 무료로 사용할 수 있는 성능이 좋아 보이는 프로그램으로 rdock이 있습니다. rdock의 차별점이라 할만한 주요 기능은 tether docking, pharmacophore docking입니다. 논문은 다음 주소에 있습니다. https://journals.plos.org/ploscompbiol/article?id=10.1371/journal.pcbi.1003571 docking을 하다 보면 대충 분자가 단백질에 어떤 포즈로 들어와야 하는지 보이는 경우가 있습니다. kinase protein의 hinge 영역처럼 특정 영역에 결합하는 분자에 몇 가지 패턴이 정해져 있는 경우도 ..

Drug/Computer-Aided Drug Discovery 2021.10.05
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캐이준 요리, Protein, Enrichment Factor, /dev/nvidia0: no such file or directory, 핫도그, 뭉티기 양념장 만들기, 볶음밥, 양다리, 복날, AutoDock Vina, 안전교육 만화, 포도주스, 인공지능 신약개발, hot dog days, 기름 안튀게 고기 굽기, 단백질 구조 예측, 인공지능 신약개발 회사, 뭉티기 양념장, 핫도그 데이, 검보 요리,

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